ヒト免疫学
(単一細胞ゲノミクス)
Human Immunology （Single Cell Genomics)
TEL 06-6879-4935(IFRec Lab) 06-6879-8323 (Biken lab)
概要
重症COVID-19回復期におけるNK細胞の多様化と適応型分化機構の解析
NK細胞はウイルス感染やがんに対する初期防御を担う自然リンパ球であるが、近年、サイトメガロウイルス感染等により免疫記憶様の形質を獲得した「適応型NK細胞（Adaptive NK cells）」へ分化することが報告されている。私たちの研究グループは、シングルセルRNAシークエンス解析を駆使し、mRNAワクチン接種者と重症COVID-19患者におけるNK細胞の応答を網羅的に比較解析した。その結果、ワクチン接種後には未熟なNK細胞が増加するのに対し、重症COVID-19からの回復期においては、強力な細胞傷害活性を持つ適応型NK細胞が特異的に誘導されることを見出した(Fig.1)。さらに軌跡解析により、NK細胞が成熟する過程で「通常型」と「適応型」へと運命決定される分岐点を同定し、適応型への分化にはT細胞受容体シグナル関連遺伝子の発現や代謝リプログラミングが関与していることを明らかにした。本研究では、環境に応じたNK細胞の多様化メカニズムを解明し、感染症やがんに対する新たな免疫制御法の開発を目指す。
Fig.1
主任研究者
奥﨑 大介 准教授
研究内容
バイオインフォマティクス、免疫学、遺伝情報学関連
学歴
| 1995.3 | 岡山大学 工学部 生物応用工学科 卒業 |
|---|---|
| 1997.3 | 岡山大学 工学研究科 生物応用工学専攻 |
| 2001.3 | 大阪大学 医学研究科 生体制御医学専攻 |
職歴
| 2002.1 | 大阪大学微生物病研究所 分子遺伝研究分野 助手 (-2004.3) |
|---|---|
| 2004.4 | 大阪大学微生物病研究所 感染症DNAチップ開発センター 助手 (2007.3) |
| 2004.4 | 大阪大学微生物病研究所 分子遺伝研究分野 助手（兼任）(2007.3) |
| 2007.4 | 大阪大学微生物病研究所 感染症DNAチップ開発センター 助教 (2017.3) |
| 2007.4 | 大阪大学微生物病研究所 分子遺伝研究分野 助教（兼任）(2017.3) |
| 2017.4 | 大阪大学微生物病研究所 遺伝情報実験センター ゲノム解析室 助教 (2019.10) |
| 2019.4 | 先導的学際研究機構, 生命医科学融合フロンティア研究部門（兼任） |
| 2019.11 | 大阪大学免疫学フロンティア研究センター ヒト免疫学（単一細胞ゲノミクス） 特任准教授 |
| 2019.11 | 大阪大学微生物病研究所 遺伝情報実験センター ゲノム解析室 特任准教授（兼任） |
| 2021.4 |
大阪大学大学院医学系研究科・大阪大学感染症総合教育研究拠点, 拠点兼任教員 |
| 2023.7 |
大阪大学 先端モダリティ・ドラッグデリバリーシステム研究センター, 臨床研究チーム（兼任） |
| 2024.10 |
大阪大学微生物病研究所バイオインフォマティクスセンター（兼任） |
| 2024.11 |
大阪大学蛋白質研究所 蛋白質先端データ科学研究センター（兼任） |
メンバー
- 奥崎 大介 准教授
dokuzakiifrec.osaka-u.ac.jp - Mohamad Al kadi 特任研究員
malkadiifrec.osaka-u.ac.jp
業績
論文
-
Ito, H., Ishikawa, M., Yoshimura, J., Liu, Y., Sakakibara, S., Sugihara, F., Matsumoto, H., Hirata, H., Ogura, H., Oda, J. & Okuzaki, D. Neutrophil gene expression in COVID-19 patients with acute respiratory distress syndrome. Front. Immunol. 16, 1620745 (2025).
-
Kishi, Y., Liu, Y. C., Ishikawa, M., Yamashita, M., Matsumoto, H., Ogura, H., Sakakibara, S. & Okuzaki, D. Mapping NK cell diversity in response to COVID-19 and mRNA vaccination. Sci. Rep. 15, 37577 (2025).
-
Al Kadi, M., Yamashita, M., Shimojima, M., Yoshikawa, T., Ebihara, H., Okuzaki, D. & Kurosu, T. Cytokine storm and vascular leakage in severe dengue: insights from single-cell RNA profiling. Life Sci. Alliance 8, e202403008 (2025).
-
Liu, Y. C., Ishikawa, M., Sakakibara, S., Kadi, M. A., Motooka, D., Naito, Y., Ito, S., Imamura, Y., Matsumoto, H., Sugihara, F., Hirata, H., Ogura, H. & Okuzaki, D. Full-length nanopore sequencing of circular RNA landscape in peripheral blood cells following sequential BNT162b2 mRNA vaccination. Gene 933, 148971 (2025).
-
Sakakibara, S., Liu, Y. C., Ishikawa, M., Edahiro, R., Shirai, Y., Haruna, S., El Hussien, M. A., Xu, Z., Li, S., Yamaguchi, Y., Murakami, T., Morita, T., Kato, Y., Hirata, H., Takeda, Y., Sugihara, F., Naito, Y., Motooka, D., Tsai, C. Y., Ono, C., Matsuura, Y., Wing, J. B., Matsumoto, H., Ogura, H., Okada, M., Kumanogoh, A., Okada, Y., Standley, D. M., Kikutani, H. & Okuzaki, D. Clonal landscape of autoantibody-secreting plasmablasts in COVID-19 patients. Life Sci. Alliance 7, e202402774 (2024).
-
Kurosu, T., Okuzaki, D., Sakai, Y., Kadi, M. A., Phanthanawiboon, S., Ami, Y., Shimojima, M., Yoshikawa, T., Fukushi, S., Nagata, N., Suzuki, T., Kamimura, D., Murakami, M., Ebihara, H. & Saijo, M. Dengue virus infection induces selective expansion of Vγ4 and Vγ6TCR γδ T cells in the small intestine and a cytokine storm driving vascular leakage in mice. PLoS Negl. Trop. Dis. 17, e0011743 (2023).
-
Ishikawa, M., Shimada, Y., Ozono, T., Matsumoto, H., Ogura, H., Kihara, K., Mochizuki, H., Okuno, T., Sakakibara, S., Kinoshita, M. & Okuzaki, D. Single-cell RNA-seq analysis identifies distinct myeloid cells in a case with encephalitis temporally associated with COVID-19 vaccination. Front. Immunol. 14, 998233 (2023).