免疫機能ゲノミクス
Functional Immunogenomics
TEL 06-6879-4926
概要
人体のすべての細胞は同じ遺伝情報を持っていますが、その共通する遺伝情報を緻密に使い分けることによって、異なる機能をもつ様々な細胞が生み出されています。近年、遺伝子工学ツールや一つ一つの細胞に適用可能なゲノミクス技術が大きく進歩したことで、これらの制御的相互作用をこれまでにない深さとスケールで研究することが可能になりました（図1）。
私たちの研究目的は、遺伝子を制御するプログラムが免疫細胞の運命と機能をどのようにコントロールしているのかを明らかにすることです。遺伝子の働きを操作した際の変化を調べるスクリーニングと、RNA・タンパク質・クロマチンなど多様な分子情報を同時に測定する単一細胞解析を組み合わせ、細胞の状態、分化、機能を支配する遺伝的・エピジェネティックなメカニズムを体系的に解明します（図2）。同時に、患者さん由来のサンプルにこれらの最先端手法を適用することで、疾患につながる免疫系の遺伝子制御の異常を特定し、どのような制御メカニズムがどの細胞状態と結びついているのかを明らかにすることが可能になります。（図2）。
これらの補完的なアプローチを通じて、免疫応答を調節するための重要な制御因子やシグナル経路を明らかにしたいと考えています。私たちは、これらの知見を疾患治療のための次世代型の免疫細胞療法へとつなげることを最終目標に研究を行っています。
主任研究者
Kelvin Chen 准教授
研究内容
免疫学、免疫ゲノミクス、遺伝子制御学
学歴
| 2014 | 大阪大学理学部生物学科 卒業 |
| 2016 | 大阪大学大学院医学系研究科医科学修士課程 修了 |
| 2021 | 大阪大学大学院医学系研究科博士課程 修了 |
職歴
| 2014 | 大阪大学免疫学フロンティア研究センター 助手 |
| 2020 | 京都大学ウイルス・再生医科学研究所 研究員 |
| 2021 | 大阪大学免疫学フロンティア研究センター 特任研究員 |
| 2021 | 大阪大学免疫学フロンティア研究センター 特任助教 |
| 2026 | 大阪大学免疫学フロンティア研究センター 准教授 |
受賞・表彰
| 2025 | 令和7年度大阪大学賞 |
メンバー
- Kelvin Chen 准教授
chenkifrec.osaka-u.ac
業績
論文
- Mikami N, Kawakami R, Chen KY, Sugimoto A, Ohkura N, Sakaguchi S. Epigenetic conversion of conventional T cells into regulatory T cells by CD28 signal deprivation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Jun 2;117(22):12258–68.
- Kawakami R, Kitagawa Y, Chen KY, Arai M, Ohara D, Nakamura Y, Yasuda K, Osaki M, Mikami N, Lareau CA, Watanabe H, Kondoh G, Hirota K, Ohkura N, Sakaguchi S. Distinct Foxp3 enhancer elements coordinate development, maintenance, and function of regulatory T cells. Immunity. 2021 May 11;54(5):947–61.e8.
- Mimitou EP, Lareau CA, Chen KY, Zorzetto-Fernandes AL, Hao Y, Takeshima Y, Luo W, Huan TS, Yeung BZ, Paplexi E, Thakore PI, Kibayashi T, Wing JB, Hata M, Satija R, Nazor KL, Sakaguchi S, Ludwig LS, Sankaran VG, Regev A, Smibert P. Scalable, multimodal profiling of chromatin accessibility, gene expression and protein levels in single cells. Nat Biotechnol. 2021 Oct;39(10):1246–58.
- Chen KY, Kibayashi T, Giguelay A, Hata M, Nakajima S, Mikami N, Takeshima Y, Ichiyama K, Omiya R, Ludwig LS, Hattori K, Sakaguchi S. Genome-wide CRISPR screen in human T cells reveals regulators of FOXP3. Nature. 2025 Mar 26;642(8066):191–200.
- Arase M, Murakami M, Kihara T, Kuwahara R, Toyota H, Sumitani N, Kinoshita N, Chen KY, Yokoi T, Motooka D, Okuzaki D, Zhao Y, Miyazaki H, Ogino T, Hirota S, Ikeuchi H, Takeda K. Multi-omics uncovers transcriptional programs of gut-resident memory CD4+ T cells in Crohn’s disease. J Exp Med [Internet]. 2025 Nov 3;222(11).